Онкологія

ALK-мутації: загальні відомості

Діагностика: загальні відомості

ALK-мутації: загальні відомості
Рекомендації NCCN Рекомендації NCCN

Згідно з рекомендаціями NCCN від 2023 року, алгоритм діагностики при прогресуючому або метастатичному раку легені повинен виглядати наступним чином1:

Алгоритм діагностики при прогресуючому/метастатичному НДКРЛ Алгоритм діагностики при прогресуючому/метастатичному НДКРЛ

Рисунок 1. Алгоритм діагностики при прогресуючому/метастатичному НДКРЛ. ALK (anaplastic lymphoma kinase, кіназа анапластичної лімфоми).

Переваги та недоліки різних методів ALK-тестування Дізнатися більше

Переваги та недоліки різних методів ALK-тестування

Переваги та недоліки різних методів ALK-тестування Дізнатися більше

Методи ALK-тестування

Загальні відомості щодо методів ALK-тестування описані нижче:

1. NGS

NGS (next-generation sequencing, секвенування нового покоління)

NGS (next-generation sequencing, секвенування нового покоління) —

технологія секвенування ДНК, яка дозволяє аналізувати мільйони фрагментів ДНК одночасно. NGS дозволяє отримати інформацію про геном людини протягом короткого часу та здатний виявляти нові партнери по злиттю ALK1-4.

NGS (next-generation sequencing, секвенування нового покоління)

2. ЗТ-ПЛР

ЗТ-ПЛР (reverse transcriptase PCR, ПЛР зі зворотною транскрипцією)

ЗТ-ПЛР (reverse transcriptase PCR, ПЛР зі зворотною транскрипцією) —

високочутливий та специфічний метод генетичного аналізу, який дає можливість ідентифікувати партнери та варіант злиття ALK. ЗТ-ПЛР може використовуватися лише для обмеженого набору варіантів, але, на відміну від NGS, практично не має сили відкриття (тобто не буде виявляти нове ALK-злиття). Перевагами методу є його доступність (обладнання наявне у більшості лабораторій) та економічна вигідність при низькій кількості цільових регіонів (≤ 20 цілей)5-8.

ЗТ-ПЛР (reverse transcriptase PCR, ПЛР зі зворотною транскрипцією)

3. FISH

ALK-тестування методом FISH

ALK-тестування методом FISH ALK-тестування методом FISH

Рисунок 3. ALK-тестування методом FISH9.

FISH (fluorescence in situ hybridization, флюоресцентна гібридизація in situ) —

цитогенетичний метод, який використовується для визначення і локалізації певної послідовності ДНК на хромосомі. Це перший клінічний тест, який став широко використовуватися для виявлення перебудов ALK при НДКРЛ. Методика FISH дозволяє виявити злиття генів у результаті між- та внутрішньохромосомних транслокацій. Зонди, які використовуються в технології, позначені двома кольорами — червоним і зеленим. Якщо у клітині немає перебудов ALK — червоний і зелений зонди призводять до жовтого (злитого) сигналу; в умовах перебудови ALK ці зонди розділяються, і спостерігається розщеплення червоного і зеленого сигналів1,6, 8,9.

4. ІГХ

ІГХ (імуногістохімія)

ІГХ (імуногістохімія) —

метод визначення онкопротеїнів у клітинах біологічних тканин на основі реакції антиген-антитіло. ІГХ є методом скринінгу та ідентифікації присутності ALK-перебудов. ІГХ-дослідження, які використовуються для визначення типу та походження пухлини (наприклад, аденокарцинома vs. плоскоклітинний рак) відрізняються від ІГХ-досліджень, які використовуються для визначення того, чи є пацієнти кандидатами на терапію інгібітором кінази анапластичної лімфоми (ALK) або терапію інгібітором PD-L1. ІГХ корисна для оцінки низькодиференційованого НДКРЛ у малих біопсійних та/або цитологічних зразках1,6,8.

ІГХ (імуногістохімія)

Рисунок 4. Механізм ІГХ: реакція антиген-антитіло.

Алгоритм ALK-тестування

Рекомендації щодо послідовності проведення ALK-тестування при аденокарциномі зображені нижче6:

Рекомендації щодо послідовності проведення ALK-тестування

Рисунок 5. Рекомендації щодо алгоритму проведення ALK-тестування при аденокарциномі. Даний алгоритм ALK-тестування з використанням різних методів передбачає досягнення максимальної чутливості та специфічності шляхом подвійного тестування (ІГХ + FISH) або NGS/ЗТ-ПЛР з подальшим третім аналізом у неузгоджених випадках.

Алгоритм ALK-тестування Алгоритм ALK-тестування

Висновки:

  • ALK-тестування повинне бути проведене усім пацієнтам з прогресуючим або метастатичним неплоскоклітинним НДКРЛ згідно з рекомендаціями NCCN від 2023 року.
  • Основні методи ALK-тестування – NGS, ЗТ-ПЛР, FISH та імуногістохімія.
  • Виявлення ALK-перебудов є важливим для призначення ефективної терапії.
icon
  1. David S. et al. NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology (NCCN Guidelines®) Non-Small Cell Lung Cancer. Version 2.2023 — February 17, 2023. Посилання: https://www.nccn.org/guidelines/recently-published-guidelines.
  2. Behjati S. et al. What is next generation sequencing? Arch Dis Child Educ Pract Ed. 2013 Dec; 98(6): 236–238. Published online 2013 Aug 28. Посилання: ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3841808/.
  3. Wilbur A. et al. Next Generation Sequencing. Abeloff's Clinical Oncology (Sixth Edition), 2020. Посилання: sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/next-generationsequencing.
  4. Liu L. et al. Comparison of next-generation sequencing systems. J Biomed Biotechnol . 2012;2012:251364. Посилання: pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22829749/.
  5. Teixidó C. et al. Concordance of IHC, FISH and RT-PCR for EML4-ALK rearrangements. Transl Lung Cancer Res. 2014;3:70-74. Посилання: ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/ PMC4367661/.
  6. Letovanec I. et al. Evaluation of NGS and RT-PCR Methods for ALK Rearrangement in European NSCLC Patients: Results from the European Thoracic Oncology Platform Lungscape Project. Journal of Thoracic Oncology. Volume 13, Issue 3, March 2018, Pages 413-425. Посилання: sciencedirect.com/science/article/pii/S1556086417330630.
  7. Advantages of next-generation sequencing vs. qPCR. Illumina. Посилання: illumina.com/science/technology/next-generation-sequencing/ngs-vs-qpcr.html. Дата звернення: 26.04.23.
  8. Solomon B. et al. Anaplastic lymphoma kinase (ALK) fusion oncogene positive non-small cell lung cancer. UpToDate. Mar 2023. Посилання: uptodate.com/contents/anaplasticlymphoma- kinase-alk-fusion-oncogene-positive-non-small-cell-lung-cancer?search=alk%2B %20nsclc&source=search_result&selectedTitle=1~150&usage_type=default&display_rank=1#.
  9. Tsao M. et al. IASLC Atlas of ALK Testing in Lung Cancer. Aurora, CO: IASLC Press; 2017. Посилання: https://issuu.com/iaslc/docs/alk-ros1_atlas_low-res. Дата звернення: 26.04.23.
  10. Цюпа І. Особливості молекулярного «портрету» раку легені у молодих пацієнтів. Тематичний номер «Онкологія, Гематологія, Хіміотерапія» № 2 (69) 2021 р. Посилання: health-ua.com/article/65617-osoblivost-molekulyarnogo-portretu-raku-legen-umolodih-patcntv.

Реєструйтеся на порталі medical-space.com.ua та отримайте ключ до нових професійних знань!

Зареєструватися